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    Plateforme Génomique : GENOM'IC

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    Responsable

     

    GENOM’IC est une plateforme technologique ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique académique, industrielle et hospitalière. Elle est spécialisée dans l’étude du génome et du transcriptome et offre différents types de  prestations basées sur les nouvelles technologies : mise à disposition d’appareils et formation à la PCR temps réel, réalisation de projet d’analyse de transcriptome et de génome  en utilisant les puces à ADN et le séquençage haut débit (depuis la prise en charge des échantillons jusqu’à l’analyse bio-informatique des données). GENOM’IC collabore également à des projets innovants en mettant à disposition les compétences techniques de son personnel et assure une veille technologique constante. La démarche qualité engagée depuis 2012 permet de garantir la qualité des manipulations réalisées et des données produites et de répondre aux exigences de ses collaborateurs.

     

    Actualités

    • Nouveaux équipements / Demandes d’équipemements

    Un Miseq® d’Illumina (financement APHP GH Cochin) est arrivé début février  sur la plate-forme. L’arrivée de ce séquenceur permet maintenant la prise en charge de projets adaptés à cet appareil : métagénomique, séquençage ciblé, séquençage de petits génomes.

    GenomIC participe à un projet de l’équipe de J Bertherat et G Assie à l’AO 2018 « Approches Single Cell pour l’étude des processus oncogéniques »  du plan Cancer. Ce projet inclut une demande de financement pour un système Chromium de 10X Genomics.

    • Les chiffres 2017

     GenomIC a traité en 2017, 1846 échantillons pour ses projets puces (répartis en 79 projets) et 1370 echantillons pour ses 37 projets NGS (610 RNAseq et 760 DNAseq).

    • Labellisations

    GenomIc est labellisée plate-forme génomique de l’Université Paris Descartes depuis 2015 et référencée parmi les plate-formes du réseau France Génomique depuis le 10 janvier 2017.

    GenomIC  est également référencée parmi les plate-formes de génomique du Cancéropole d’Ile de France depuis 2015.

    • Participations à des projets collaboratifs

    GenomIC est impliquée dans le WP5 du projet RHU QUID NASH sélectionné par l’ANR en 2017. GenomIC réalisera les analyses transcriptomiques (mRNA et miRNA) d’une cohorte de 600 patients diéabétiques. L’objectif du projet est l’identification de marqueurs non invasifs spécifiques de la NASH (Non-Alcoholic SteatoHepatitis (NASH)) afin d’établir une biopsie virtuelle du foie.

    • Organisation séminaire, formation

    GenomIC organisera du 12 au 15 novembre 2018 une formation PCR quantitative pour le CNRS.

    GenomIC est partenaire depuis 2010 du Master 2 Ingenierie de plate-forme / université Paris Diderot : responsables : V Gruber / P Bourdoncle

    GenomIC intervient depuis 2011 dans le cadre de l’UE Approches moléculaires globales en pharmacologie et toxicologie du M1 Toxicologie de l’Université Paris Descartes.

    GenomIC participera à une UE omiques dans le cadre de la licence L2 Maths Infos de l’Université Paris Descartes en 2017.

    GenomIC a assuré depuis 2011 la formation en interne d’une cinquantaine de personnels et d’étudiants à la PCR en temps réel.

    GenomIC assure une formation au sein de deux DU :

    - DU Approches fondées sur le NGS et applications au diagnostic génétique et à la stratification thérapeutique / Université Paris Descartes

    - DIU d'Oncologie moléculaire interSIRICs IDF

     

     

     

    Financeurs

     

     

     

    Contact

    Plateforme GENOMIC
    Batiment G Roussy 3ème étage
    27 rue du faubourg Saint Jacques
    75014 Paris

    +33 (0) 140516565