Institut de recherche biomédicale
     
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    Logiciels d'analyse

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    Différents logiciels d'analyse en Cytométrie de flux sont à la disposition des utilisateurs : soit sur des postes d'analyse disponibles dans la pièce 312 au 3ème étage de Roussy, soit directement installés sur votre ordinateur :

     

    le logiciel Cytobank :

    - Permet de faire des analyses non supervisées (tSNE, SPADE, Citrus) avec une interface graphique.

    - CYBIO propose des formations sur ce logiciel : contacter la plateforme pour plus de renseignements.

    - Pour l'instant, la plateforme dispose d'une licence qu'elle partage avec les utilisateurs internes de façon gratuite.

     

    le logiciel FACS Diva :

    - Permet d'analyser les datas provenant des cytomètres BD Biosciences (LSRII, Fortessa, ARIA...)

    - Disponible pièce 312 (PC) : poste d'analyse Diva 1 (version 6), poste d'analyse Diva 2 (version 8)

     

    le logiciel CFLOW Plus :

    - Permet d'analyser les datas provenant de l'Accuri C6

    - Disponible pièce 312 (PC) ou sur votre ordinateur : Gratuit (version MAC et PC)

    - Disponible pour PC et MAC, dans "commun" sur 'Controleur du domaine ic.fr (pdc-samba)' puis "Commun-Institut-Cochin" puis "Logiciels CYBIO"  puis "C6 software MAC ou PC"

    - Possible de faire des compensations, des overlays, de copier directement les plots sur power point et d'exporter des statistiques sur excel (count, volume, Events/µl, % of this plot, % of all, Mean, CV et Median)

     

    le logiciel Kaluza :

    - Permet d'analyser les datas enregistrées sur tous les cytomètres (mais de préférence sur les appareils Coulter : on retrouve la page d'analyse déjà créée)

    - Disponible pièce 312 ou sur votre ordinateur : Gratuit version PC (Windows XP, Vista ou Windows 7)

    - Contacter la plate-forme pour l'installation

    - Possible de faire des compensations, des overlays, des plots multi-paramétriques (Tree Plot et Radar Plot), des merges de datas, des analyses de multi-fichiers, de faire des batches, de réaliser une feuille d'analyse et d'avoir des statistiques

    - procédure d'installation et  Tutoriel disponible

     

    le logiciel FlowJo :

    - Permet d'analyser les datas enregistrées sur tous les cytomètres (fichiers fcs 2.0 et 3.0)

    - Disponible pièce 312 (sur MAC) ou sur votre ordinateur : Payant : 270 euros par poste  (version MAC et PC) et par an (toute année commencée est due, l'échéance courant du 1er décembre de l'année n au 1er décembre n+1 et sera inclue dans le relevé du dernier trimestre n+1)

    - Suivre la procédure d'installation pour l'installer

    - Possible de faire des compensations, des overlays, de réaliser une feuille d'analyse, d'avoir différents groupes d'analyse, d'obtenir des statistiques et de faire des cinétiques (cycle cellulaire, prolifération, études de flux et comparaisons de populations).

     

     

     

     

    Mots-clés associés : cytométrie en flux, logiciels d'analyse